Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc22Q9JIG7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc22Q9JIG7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms