Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIC3

Dclre1a, DNA cross-link repair 1A protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1aQ9JIC3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Dclre1aQ9JIC3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dclre1aQ9JIC3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms