Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tm9sf3Q9ET30 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms