Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
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Rb1cc1Q9ESK9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Rb1cc1Q9ESK9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rb1cc1Q9ESK9 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Rb1cc1Q9ESK9 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rb1cc1Q9ESK9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rb1cc1Q9ESK9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rb1cc1Q9ESK9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rb1cc1Q9ESK9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
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Rb1cc1Q9ESK9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rb1cc1Q9ESK9 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rb1cc1Q9ESK9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rb1cc1Q9ESK9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rb1cc1Q9ESK9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rb1cc1Q9ESK9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rb1cc1Q9ESK9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rb1cc1Q9ESK9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Rb1cc1Q9ESK9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Rb1cc1Q9ESK9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rb1cc1Q9ESK9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rb1cc1Q9ESK9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Rb1cc1Q9ESK9 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rb1cc1Q9ESK9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rb1cc1Q9ESK9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rb1cc1Q9ESK9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rb1cc1Q9ESK9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rb1cc1Q9ESK9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Rb1cc1Q9ESK9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rb1cc1Q9ESK9 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rb1cc1Q9ESK9 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
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Rb1cc1Q9ESK9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
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Rb1cc1Q9ESK9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
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Rb1cc1Q9ESK9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rb1cc1Q9ESK9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
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Rb1cc1Q9ESK9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rb1cc1Q9ESK9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rb1cc1Q9ESK9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
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Rb1cc1Q9ESK9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
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Rb1cc1Q9ESK9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
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Rb1cc1Q9ESK9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rb1cc1Q9ESK9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rb1cc1Q9ESK9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rb1cc1Q9ESK9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rb1cc1Q9ESK9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Rb1cc1Q9ESK9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rb1cc1Q9ESK9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Rb1cc1Q9ESK9 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rb1cc1Q9ESK9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rb1cc1Q9ESK9 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rb1cc1Q9ESK9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rb1cc1Q9ESK9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rb1cc1Q9ESK9 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rb1cc1Q9ESK9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rb1cc1Q9ESK9 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Rb1cc1Q9ESK9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
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