Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DysfQ9ESD7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms