Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ush1cQ9ES64 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms