Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE8

Tlnrd1, Talin rod domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlnrd1Q9ERE8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tlnrd1Q9ERE8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms