Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r44Q9EQ47 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms