Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cxcr6Q9EQ16 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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