Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnft1Q9DCN7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms