Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk1dQ9DC28 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Csnk1dQ9DC28 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Csnk1dQ9DC28 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Csnk1dQ9DC28 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk1dQ9DC28 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms