Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf6Q9DBU5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf6Q9DBU5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms