Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc97Q9DBT3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms