Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR4

Apbb2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb2Q9DBR4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apbb2Q9DBR4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms