Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrpraQ9DBG7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms