Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg9Q9DB90 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms