Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc89Q9DA73 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc89Q9DA73 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms