Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift43Q9DA69 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ift43Q9DA69 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms