Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cnot8Q9D8X5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms