Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P4

Mrpl17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl17Q9D8P4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Mrpl17Q9D8P4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl17Q9D8P4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Mrpl17Q9D8P4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl17Q9D8P4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Mrpl17Q9D8P4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms