Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V1

Sh2d4a, SH2 domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d4aQ9D7V1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d4aQ9D7V1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms