Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Rep15Q9D7T1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rep15Q9D7T1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Rep15Q9D7T1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Rep15Q9D7T1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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