Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmigd1Q9D7L8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms