Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
2310002L09RikQ9D7L5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
2310002L09RikQ9D7L5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
2310002L09RikQ9D7L5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
2310002L09RikQ9D7L5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
2310002L09RikQ9D7L5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
2310002L09RikQ9D7L5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
2310002L09RikQ9D7L5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
2310002L09RikQ9D7L5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
2310002L09RikQ9D7L5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
2310002L09RikQ9D7L5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
2310002L09RikQ9D7L5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
2310002L09RikQ9D7L5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
2310002L09RikQ9D7L5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
2310002L09RikQ9D7L5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
2310002L09RikQ9D7L5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
2310002L09RikQ9D7L5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
2310002L09RikQ9D7L5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
2310002L09RikQ9D7L5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
2310002L09RikQ9D7L5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
2310002L09RikQ9D7L5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
2310002L09RikQ9D7L5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
2310002L09RikQ9D7L5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
2310002L09RikQ9D7L5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
2310002L09RikQ9D7L5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
2310002L09RikQ9D7L5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms