Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns2Q9D7J7 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms