Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 192.8 ms