Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6X5

Slc52a3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a3Q9D6X5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc52a3Q9D6X5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc52a3Q9D6X5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms