Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Ccdc39Q9D5Y1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Ccdc39Q9D5Y1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
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Ccdc39Q9D5Y1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Ccdc39Q9D5Y1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc39Q9D5Y1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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