Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrameQ9D4Z5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms