Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc105Q9D4K7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc105Q9D4K7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc105Q9D4K7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc105Q9D4K7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc105Q9D4K7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc105Q9D4K7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc105Q9D4K7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc105Q9D4K7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc105Q9D4K7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc105Q9D4K7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc105Q9D4K7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc105Q9D4K7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc105Q9D4K7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc105Q9D4K7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc105Q9D4K7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc105Q9D4K7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc105Q9D4K7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc105Q9D4K7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc105Q9D4K7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc105Q9D4K7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc105Q9D4K7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc105Q9D4K7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc105Q9D4K7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc105Q9D4K7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc105Q9D4K7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms