Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lonrf3Q9D4H7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms