Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sohlh2Q9D489 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sohlh2Q9D489 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms