Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim42Q9D2H5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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