Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pramef12Q9D2F1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms