Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2E1

Tssk3, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssk3Q9D2E1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tssk3Q9D2E1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms