Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms