Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms