Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Shmt2Q9CZN7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms