Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thumpd2Q9CZB3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Thumpd2Q9CZB3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Thumpd2Q9CZB3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Thumpd2Q9CZB3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Thumpd2Q9CZB3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd2Q9CZB3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd2Q9CZB3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd2Q9CZB3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd2Q9CZB3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd2Q9CZB3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd2Q9CZB3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd2Q9CZB3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd2Q9CZB3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd2Q9CZB3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd2Q9CZB3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd2Q9CZB3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd2Q9CZB3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd2Q9CZB3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd2Q9CZB3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd2Q9CZB3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd2Q9CZB3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd2Q9CZB3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd2Q9CZB3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd2Q9CZB3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd2Q9CZB3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd2Q9CZB3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thumpd2Q9CZB3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thumpd2Q9CZB3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thumpd2Q9CZB3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thumpd2Q9CZB3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thumpd2Q9CZB3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thumpd2Q9CZB3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thumpd2Q9CZB3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thumpd2Q9CZB3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thumpd2Q9CZB3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Thumpd2Q9CZB3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thumpd2Q9CZB3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Thumpd2Q9CZB3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Thumpd2Q9CZB3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 175.3 ms