Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nde1Q9CZA6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms