Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms