Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prdm5Q9CXE0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm5Q9CXE0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms