Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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