Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd12Q9CWU0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms