Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NubplQ9CWD8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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