Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS42

Prps2, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 2, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prps2Q9CS42 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prps2Q9CS42 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prps2Q9CS42 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms