Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ska2Q9CR46 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ska2Q9CR46 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms