Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX0

Otub2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otub2Q9CQX0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Otub2Q9CQX0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otub2Q9CQX0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms