Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rer1Q9CQU3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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