Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Rdm1Q9CQK3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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